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质谱仪器帮助科学家发现蛋白质组学重要成果

时期:2022-03-21 03:17 点击数:
本文摘要:最近,来自瑞士和荷兰的科学家,对在22种有所不同生长条件下大肠杆菌传达的蛋白质,展开了定量和定性分析。确认了多达2300个蛋白质,其中一些正处于每个细胞一个副本的平均水平。 由此产生的数据集叙述了细胞中大多数(90%)的蛋白质量,对细胞生物学家来说这将是一个宝藏。涉及研究结果公开发表在十二月出版发行的《NatureBiotechnology》。伸延读者:PNAS揭露蛋白质组的暗物质。

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最近,来自瑞士和荷兰的科学家,对在22种有所不同生长条件下大肠杆菌传达的蛋白质,展开了定量和定性分析。确认了多达2300个蛋白质,其中一些正处于每个细胞一个副本的平均水平。

由此产生的数据集叙述了细胞中大多数(90%)的蛋白质量,对细胞生物学家来说这将是一个宝藏。涉及研究结果公开发表在十二月出版发行的《NatureBiotechnology》。伸延读者:PNAS揭露蛋白质组的暗物质。  为了理解细胞内的基因组信息和它们的生理机能之间的关系,最重要的是要评估哪些基因在有所不同条件下积极参与产生蛋白质。

搜集这些信息的最必要的方式是,对细胞中不存在的蛋白质展开定量测量。  随着技术的变革,最近才使得意味著蛋白质水平的大规模测量沦为有可能。来自巴塞尔大学和苏黎世大学(瑞士)、格罗宁根大学(荷兰)的科学家们,合力测量在22种有所不同条件下生长的大肠杆菌中的蛋白质。

用于质谱法为基础的蛋白质组学方法,他们不仅确认了不存在哪些蛋白质,而且还确认了每个细胞中有多少个副本。  大型数据集  系统生物学教授MatthiasHeinemann说道,来自大规模数据集的结果,将鼓舞更加多新的研究成果,他与巴塞尔大学的AlexanderSchmidt一起协商实验。他说明说道:我们顺利地分析了这些细胞中百分之90的蛋白质量。我们找到,有多达2300种有所不同的蛋白质,代表着4300个细菌基因中的多达一半。

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这使大肠杆菌中意味著定量的蛋白质数量减少了一倍。对于这些蛋白质中的一些,还没确认其功能。但是,通过研究多达22种有所不同生长条件下的传达模式,我们现在取得了一个关于它们正在做到什么的线索。

  免费索要LifeTech蛋白质组学产品信息  蛋白质有十分有所不同的传达水平,从每个细胞平均值多达100000个副本,到两个、一个甚至较少的水平。Heinemann说道:首先,这指出我们的方法是多么的脆弱,但它也不会让你想要告诉,在非常低的水平传达的蛋白质有什么功能,通过纯粹的随机效应,虽然一些基因有可能是活跃的(从而随机产生蛋白质),但我们并不回避一个细胞中一个蛋白单拷贝的一种必要功能。却是,其他的生物实体表明为单拷贝(如基因),也具备一种功能,研究还找到了对细菌蛋白质的新翻译成后适应性。

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  新问题  在这篇论文中叙述的数据集,正在被其他科学家所用于,并引起了新的令人兴奋的研究调查。作者认为:我们的数据将作为新的研究的参照数据,并早已促使了一些于是以待出版发行的研究结果。这个数据集可让科学家们需要明确提出并问新的问题。

  对于这项研究,在有所不同条件下生长的细菌是在格罗宁根大学培育的。样品被运往巴塞尔大学,蛋白质含量(还包括膜融合蛋白)是通过质谱分析法分离出来和分析的。最后,整个团队对这些结果展开了分析。


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